Complete Genome Sequence of Enterobacter Phage vB_EcRAM-01, a New Pseudotevenvirus against the Enterobacter cloacae Complex.

Here, we present the complete genome sequence of Enterobacter phage vB_EcRAM-01, isolated from waters of the Río Abajo river, in Panama City, Panama. This phage has deployed lytic activity against the Enterobacter cloacae complex, a pathogen of clinical importance in intensive care units. It belongs to the Myoviridae family and has a double-stranded DNA genome that is 178,477 bp long and contains 293 open reading frames (ORFs).

Molecular Epidemiology of Dengue in Panama: 25 Years of Circulation.

Dengue virus (DENV) is the most prevalent arbovirus in terms of human public health importance globally. In addition to DENV epidemiological surveillance, genomic surveillance may help investigators understand the epidemiological dynamics, geographic distribution, and temporal patterns of DENV circulation. Herein, we aimed to reconstruct the molecular epidemiology and phylogeny of DENV in Panama to connect the epidemiological history of DENV dispersal and circulation in Latin America. We retrospectively analyzed the epidemiological data obtained during 25 years of DENV surveillance in Panama. DENV was reintroduced in Panama in 1993 after a 35 year absence of autochthonous transmission. The increase in the number of total dengue cases has been accompanied by an increase in severe and fatal cases, with the highest case fatality rate recorded in 2011. All four serotypes were detected in Panama, which is characterized by serotype replacement and/or co-circulation of multiple serotypes. Phylogenetic analysis of datasets collected from envelope (E) gene sequences obtained from viruses isolated from human sera demonstrated that circulating viruses were highly diverse and clustered in distinct clades, with co-circulation of clades from the same genotype. Our analyses also suggest that Panamanian strains were related to viruses from different regions of the Americas, suggesting a continuous exchange of viruses within the Americas.

Characterization of the Punta Toro species complex (genus Phlebovirus, family Bunyaviridae).

Punta Toro virus (PTV), a member of the PTV complex, is a relatively common causative agent of febrile illness in Panama that is often misdiagnosed as 'dengue' or 'influenza'. Currently, only two named members make up this species complex, PTV and Buenaventura virus (BUEV). Genomic and antigenic characterization of 17 members of the PTV complex, nine of which were isolated from human acute febrile illness cases, reveals that this species complex is composed of six distant viruses. We propose to add four additional new viruses, designated Leticia virus, Cocle virus, Campana virus and Capira virus.

Distribución y susceptibilidad antifúngica de especies de Candida aisladas de hemocultivos en el Hospital del Niño del 2009 al 2010

El incremento en los últimos 10 años de los episodios de candidemia, la identificación de especies inusuales de Candida usando sistemas fenotípicos, la resistencia intrínseca y emergente en aislados clínicos a distintos antifungicos son elementos que nos conducen a realizar identificaciones más precisas y conocer los perfiles de susceptibilidad de las especies de Candida asociadas a fungemias. Objetivo: Realizamos una caracterización genotípica y fenotípica de los aislados clínicos de levaduras procedentes de muestras de hemocultivos de pacientes hospitalizados en el Hospital del Niño del periodo 2009 al 2010, para determinar la frecuencia de distribución las especies de Candida asociadas a fungemia y sus respectivos perfiles de susceptibilidad. Material y método: Se recolectaron un total de 55 cepas de Candida spp y levaduras relacionadas. Sólo se incluyó pacientes hospitalizados con hemocultivos positivos cuyo agente etiológico fueran levaduras y un sólo episodio por paciente, en las salas de Hemato-Oncología , Neonatología, Quemados, Medicina 6 y la Unidad de Terapia Intensiva del Hospital del Niño en el periodo de mayo 2009 a 2010. Se evaluaron 55 cepas, las cuales fueron identificadas usando el Vitek2, la prueba pagar harina de maíz y el método de PCR fingerprinter. Los patrones de bandas de los aislados clínicos fueron comparados con cepas de referencia para confirmar las identificaciones fenotípicas. Se realizaron pruebas de susceptibilidad para 6 antifúngicos de uso sistémico. Resultados: La distribución global final fue la siguiente: complejo de Candida parapsilosis (40%), Candida tropicalis (29.1%), Candida albicans (20%) Candida guilliermondi (3.6%), Sporobolomyces salmonicolor (1.8%), Saccharomyces cerevisiae (1.8%) y complejo Candida haemulonii (3.6%). Las especies del complejo C.parapsilolis presentó 6.3% resistencia a caspofungina y a itraconazol, mientras que C.albicans resultó con 18.2% de resistencia a caspofungina y anfotericina B, y 9.1% de resistencia a fluconazol, itraconazol y voriconazol. Algunas cepas de C.albicans fueron resistentes a varios antifúngicos. Conclusiones: A pesar de las limitaciones del sistema bioquímico automatizado Vitek2, resulta una herramienta útil para la identificación de los aislados clínicos de Candida app. Las pruebas de susceptibilidad usando el método de difusión con pagar Mullër Hinton dosificado resultó altamente confiable y reproducible. Candida parapsilosis fue la causa de fungemia en el Hospital del Niño durante el periodo de estudio. La resistencia a los distintos antifúngicos de los aislados clínicos de Candida spp. no excedió el 10% excepto por caspofungina.

Introduction: The increase in the last 10 years of episodes of candidemia, identification of unusual Candida species using phenotypic systems, intrinsic and emerging resistance in clinical isolates are different anti fungal elements that lead us to make more accurate identifications and knowing the profiles susceptibility of Candida species associated fungemia. Objetive: We do a genotypic and phenotypic characterization of clinical isolates of yeasts from blood cultures of hospitalized patients in the Hospital del Niño period 2009 to 2010 to determine the frequency distribution of Candida species associated with fungemia and their respective profiles susceptibility. Methods: A total of 55 strains of Candida spp and related yeasts were collected. Only hospitalized patients with positive blood cultures whose etiologic agent were yeasts and one episode per patient, in the halls of Hematology - Oncology, Neonatology, Burned, Medicine 6 and the Intensive Care Unit at Hospital del Niño between May 2009 included 2010. The 55 strains were evaluated, which were identified using the VItek2 system, Cornmeal agar test and PCR method fingerprinter. The banding patterns of clinical isolates were compared with reference strains to confirm phenotypic identifications. Susceptibility test were performed for 6 anti fungal for systemic use. Results: The global final distribution was as follows: Candida parapsilosis complex (40%), Candida tropical (29.1%), Candida albinas (20%), Candida gulliermondi (3.6%), Sporobolomyces salmonicolor (1.8%), Saccharomyces cerevisiae (1.8%), Candida complex haemulonii (3.6%). C.parapsilosis complex species showed 77.3% resistance to caspofungin and itraconazole 4.3%; C.tropicalis presented 6.3% resistance to caspofungin and itraconazole while C.albicans resulted with 18.2% resistance to caspofungin and amphotericin B, and 9.1% resistance to fluconazole, itraconazole and voriconazole. Some strains of C.albicans were resistance to several antifungal. Conclusions: Despite the limitations of automated biochemistry Vitek2 system, is a useful tool for identifying clinical isolates of Candida spp. Susceptibility tests using the agar diffusion method was dosed Muller Hinton highly reliable and reproducible. Candida parapsilosis was the main cause of fungemia in the Hospital del Niño during the study period. Resistance to antifungal different clinical isolates of Candida spp did not exceed 10% except for caspofungin.

Venezuelan equine encephalitis in Panama: fatal endemic disease and genetic diversity of etiologic viral strains.

Venezuelan equine encephalitis (VEE) is a reemerging, mosquito-borne viral disease of the neotropics that is severely debilitating and sometimes fatal to humans. Periodic epidemics mediated by equine amplification have been recognized since the 1920s, but interepidemic disease is rarely recognized. We report here clinical findings and genetic characterization of 42 cases of endemic VEE detected in Panama from 1961-2004. Recent clusters of cases occurred in Darien (eastern Panama) and Panama provinces (central Panama) near rainforest and swamp habitats. Patients ranged from 10 months to 48 years of age, and the more severe cases with neurological complications, including one fatal infection, were observed in children. The VEE virus strains isolated from these cases all belonged to an enzootic, subtype ID lineage known to circulate among sylvatic vectors and rodent reservoir hosts in Panama and Peru. These findings underscore endemic VEE as an important but usually neglected arboviral disease of Latin America.

Clinical characteristics and national economic cost of the 2005 dengue epidemic in Panama.

In 2005, Panama experienced the largest dengue epidemic since 1993. We conducted both a prospective clinical and a national economic study. The full cost analysis measured costs of dengue cases and of dengue control efforts in the entire country. Costs are in 2005 US$. Ambulatory patients were 130 of the 136 participants, with 82% adults (18+) and 62% women. Duration of fever and illness averaged 6.1 (standard deviation [SD], 5.3) and 21.2 (SD 13.5) days, respectively. Loss in quality of life averaged 67% (SD 21) during the worst days of illness. An average ambulatory and hospitalized case cost $332 and $1,065, respectively. Although 5,489 cases were officially reported, the Ministry of Health (MOH) estimated 32,900 actual cases, implying a total cost of $11.8 million. Additionally, estimated government spending on dengue control efforts was $5 million. This dengue epidemic had a major disease impact and an economic cost of $16.9 million ($5.22 per capita).

Outbreak of hantavirus pulmonary syndrome, Los Santos, Panama, 1999-2000.

An outbreak of hantavirus pulmonary syndrome occurred in the province of Los Santos, Panama, in late 1999 and early 2000. Eleven cases were identified; 9 were confirmed by serology. Three cases were fatal; however, no confirmed case-patient died. Case-neighborhood serologic surveys resulted in an overall hantavirus antibody prevalence of 13% among household and neighborhood members from the outbreak foci. Epidemiologic investigations did not suggest person-to-person transmission of hantavirus infection. By use of Sin Nombre virus antigen, hantavirus antibodies were detected in Oligoryzomys fulvescens and Zygodontomys brevicauda cherriei. This outbreak resulted in the first documented cases of human hantavirus infections in Central America.

High seroprevalence of hantavirus infection on the Azuero peninsula of Panama.

The first outbreak of hantavirus pulmonary syndrome (HPS) in Central America was documented on the Azuero peninsula of Panama in late 1999 and 2000. Reverse transcriptase-polymerase chain reaction evidence implicated only Choclo virus in symptomatic HPS with a mortality rate of 20%, although two rodent-borne hantaviruses (Choclo virus and Calabazo virus) were identified in the peridomestic habitat. Neighborhood serosurveys around case households found seroprevalence rates as high as 30%, the highest in the Americas except for western Paraguay. We report here population-based serosurveys for 1,346 adults and children in four communities, three on the Azuero peninsula and one in adjacent central Panama. Overall seroprevalence ranged from 33.2% in a population engaged in farming and fishing on Isla de Cañas, to 16.3% and 21.2% in two mainland agricultural communities, to 3.1% in central Panama, with a modest male predominance of 1.2:1. Nine percent of children 4-10 years old were seropositive, and seroprevalence increased with age in all communities, with highest levels of 52% in those 41-50 years old cohort on Isla de Cañas. Univariate analysis identified correlations between seroprevalence and multiple agricultural and animal husbandry activities. However, stepwise logistic regression models identified only raising animals (cows, pigs, goats, poultry) and fishing as significant independent variables. Human infection with hantavirus on the Azuero peninsula, either with Choclo virus or combined with Calabazo virus, is frequent but rarely results in hospitalization due to respiratory illnesses resembling HPS.

Desarrollo de un programa de promoción y prevención del dengue con un enfoque ecosistémico desde la perspectiva de género, en un sector del corregimiento de Pacora, región metropolitana de Panamá / Development program of promotion and prevention of the dengue with a ecosistemic focus since the perspective of kind in a sector of Pacora corregiment, Panamá metropolitan region

Análisis transdisciplinario e intersectorial que desarrolla metodologías participativas e involucra a diferentes actores comunitarios como agentes de cambio, tomando en consideración los distintos roles de hombres y mujeres

Conocimientos, actitudes y prácticas sobre dengue en Barrio Balboa y la 24 de Diciembre. Panamá 2002 / Knowledge attitudes and practical about dengue in Barrio Balboa and 24 de Diciembre. Panama 2002

Describe el problema del dengue y las investigaciones participativas que se realizan con la población, y los sub-registros de los casos reportados que impiden conocer la magnitud y distribución real de este problema de salud, que tiende a concentrarse en los lugares con mayor densidad de población, principalmente entre los campesinos inmigrantes y los indígenas,lo que limita las oportunidades de desarrollo y bienestar de la población

Dengue en Panamá, 1993 / Dengue in Panama, 1993

Hasta 1993, Panamá era el único país de Centroamérica que había detectado transmisión autóctona de virus dengue sin experimentar una epidemia explosiva, pese a estar reinfestado con el mosquito Aedes aegypti desde 1985. En este trabajo se describen las características de este primer brote reportado el 19 de noviembre de 1993 y se demuestra que las epidemias se presentan a pesar de mantener un Programa de Vigilancia y Control para Dengue -que contempla bajos niveles de infestación del Aedes aegypti y un sistema de detección temprano del virus- si la comunidad no participa activamente como ocurrió posteriormente durante 1994, 1995 y 1996. Los 14 casos reportados se localizaron en un área bajo la responsabilidad del Centro de Salud de San Isidro, en el corregimiento Belisario Porras, Distrito Especial de San Miguelito, en la Ciudad de Panamá (13 caso en 4 manzanas del sector de Santa Librada y 1 caso en el Valle de San Isidro). Tres pacientes eran menores de 15 años y 8 eran mayores de 36 años, la edad de los restantes fluctúo entre 15 y 24 años, 9 eran del sexo femenino. En 3 pacientes se aisló el virus dengue tipo 2. En otros 11 se demostró la presencia de anticuerpos IgM e IgG para dengue. En 8 mayores de 20 años, se observó una respuesta de tipo secundaria. De acuerdo con el cuadro clínico, la epidemia se clasificó como de fiebre del dengue. La encuesta seroepidemiológica realizada en el sector de Santa Librada y sus alrededores, 5 meses después del inicio de los síntomas del primer caso, demostró una prevalencia de anticuerpos para dengue de 5,7 por ciento (46/802), principalmente en individuos mayores de 44 años de edad. Estos resultados confirmaron que el brote estuvo limitado geográficamente

Dengue en Panamá, 1993 / Dengue in Panama, 1993

Hasta 1993, Panamá era el único país de Centroamérica que había detectado transmisión autóctona de virus dengue sin experimentar una epidemia explosiva, pese a estar reinfestado con el mosquito Aedes aegypti desde 1985. En este trabajo se describen las características de este primer brote reportado el 19 de noviembre de 1993 y se demuestra que las epidemias se presentan a pesar de mantener un Programa de Vigilancia y Control para Dengue -que contempla bajos niveles de infestación del Aedes aegypti y un sistema de detección temprano del virus- si la comunidad no participa activamente como ocurrió posteriormente durante 1994, 1995 y 1996. Los 14 casos reportados se localizaron en un área bajo la responsabilidad del Centro de Salud de San Isidro, en el corregimiento Belisario Porras, Distrito Especial de San Miguelito, en la Ciudad de Panamá (13 caso en 4 manzanas del sector de Santa Librada y 1 caso en el Valle de San Isidro). Tres pacientes eran menores de 15 años y 8 eran mayores de 36 años, la edad de los restantes fluctúo entre 15 y 24 años, 9 eran del sexo femenino. En 3 pacientes se aisló el virus dengue tipo 2. En otros 11 se demostró la presencia de anticuerpos IgM e IgG para dengue. En 8 mayores de 20 años, se observó una respuesta de tipo secundaria. De acuerdo con el cuadro clínico, la epidemia se clasificó como de fiebre del dengue. La encuesta seroepidemiológica realizada en el sector de Santa Librada y sus alrededores, 5 meses después del inicio de los síntomas del primer caso, demostró una prevalencia de anticuerpos para dengue de 5,7 por ciento (46/802), principalmente en individuos mayores de 44 años de edad. Estos resultados confirmaron que el brote estuvo limitado geográficamente(AU)

Seroepidemiología del virus HTLV-III en una población de panameños de alto riesgo: informe preliminar / Seroepidemiology of the virus HTLV-III in a population of Panamenian of high risk: preliminary report

Durante el período comprendido entre Abril de 1984 a Septiembre de 1985 se estudiaron 215 homosexuales masculinos que acudieron voluntariamente a clínicas especiales, coordinados por el Laboratorio Conmemorativo Gorgas, el Complejo Hospitalario Metropolitano de la Caja de Seguro Social y el Instituto Oncológico Nacional. A cada uno de ellos se le efectuó una encuesta epidemiológica orientada a evaluar factores de riesgo para la infección con el HTLV-III, un examen físico completo que incluyó la toma de muestra de faringe, recto y uretra para determinar la presencia de agentes causales de enfermedades de transmisión sexual (N. gonorrhoeae, Chlamydia, Mycoplasma, Citomegalovirus, Herpes), y una muestra de sangre para hemograma, serología del HTLV-III, hepatitis (A y B) y sífilis. De las 215 personas estudiadas, 8 (3.7%) presentaron serología positiva para el HTLV-III. Los factores de riesgo epidemiológicos encontrados como significativos para la infección con este virus fueron los viajes a Estados Unidos y el contacto sexual con estadounidenses, dentro o fuera del país. La seroprevalencia en el grupo fue de 3.7%, un porcentaje bajo de seropositividad para el HTLV-III

Radiculomielitis post-conjuntivitis hemorrágica aguda por enetrovireus 70: informe del primer caso comprobado en America / Radiculomyelitis following acute hemorrhagic conjunctivitis due to Enterovirus 70: report of a first confirmed case in America

Se informa el primer caso confirmado de radiculomielitis post-conjuntivitis hemorrágica aguda (CHA) ocurrido en Panamá y probablemente en el continente americano. Se describen sus características epidemiológicas, las manifestaciones clínicas y su diagnóstico virológico

La epidemia de meningitis viral por Echo 4 ocurrida em Panamá durante 1981 / Viral meningitis outbreack caused by Echo 4 ocurred in Panama during 1981

Se informa la epidemia de meningitis viral por ECHO 4 ocurrida en la ciudad capital durante 1981, la cual resultó la más grande ocurrida en la historia de Panamá y una de las más grandes epidemias comprobadas en la literatura. Se describen sus características clínicas y epidemiológicas, y se analizan las interrogantes que surgieron en la comunidad durante el desarrollo de las mismas